MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004842	GT	3	6	3106	3111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004842	ATG	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004842	TGT	2	6	4237	4242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004842	TGT	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004842	TGC	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004842	TGG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004842	TTA	2	6	6638	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004842	AG	3	6	6660	6665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004842	T	6	6	6693	6698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004842	TGA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004842	CTG	2	6	6773	6778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004842	AC	3	6	6779	6784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004842	CGGA	2	8	6821	6828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004842	ACGT	2	8	6865	6872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004842	TCCG	2	8	6901	6908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004842	GCC	2	6	8373	8378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_004842	CTTC	2	8	9906	9913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004842	GGGTC	2	10	9922	9931	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_004842	CCCGG	2	10	9955	9964	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_004842	C	6	6	9976	9981	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_004842	TC	3	6	10002	10007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004842	AC	3	6	10032	10037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_004842	TA	3	6	10050	10055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004842	TG	3	6	10063	10068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004842	CG	3	6	11227	11232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004842	TGA	2	6	11337	11342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004842	TGC	2	6	11344	11349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004842	TGC	2	6	11470	11475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004842	ACG	2	6	11480	11485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_004842	GC	3	6	13560	13565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004842	GCG	2	6	13573	13578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004842	GC	3	6	13680	13685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004842	GCC	2	6	14883	14888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_004842	AGT	2	6	14903	14908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004842	ACC	2	6	14940	14945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_004842	CG	3	6	14951	14956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_004842	GCA	2	6	14967	14972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004842	ATC	2	6	14992	14997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_004842	GCA	2	6	15001	15006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_004842	GT	3	6	15014	15019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004842	GCT	2	6	15926	15931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004842	GGC	2	6	15944	15949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004842	TGG	2	6	18329	18334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004842	TGC	2	6	18364	18369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_004842	TA	3	6	18415	18420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004842	CTTG	2	8	21232	21239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_004842	TGG	2	6	21258	21263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004842	CGC	2	6	21296	21301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_004842	GTAT	2	8	21318	21325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004842	ACC	2	6	23402	23407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_004842	ACC	3	9	23453	23461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_004842	CAG	2	6	23479	23484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_004842	CAC	2	6	23883	23888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_004842	GGA	2	6	24231	24236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004842	GAAGTA	2	12	24246	24257	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004842	AAG	2	6	24288	24293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004842	TTA	2	6	24321	24326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004842	AAG	2	6	24411	24416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004842	AG	3	6	24431	24436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004842	ACT	2	6	24447	24452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004842	GTG	2	6	24454	24459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004842	AAG	2	6	24471	24476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004842	GT	3	6	24477	24482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004842	CCA	2	6	24523	24528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_004842	GCA	2	6	24532	24537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004842	CAA	2	6	24539	24544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004842	TCA	2	6	24591	24596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_004842	TCC	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_004842	CAT	2	6	24734	24739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004842	TGG	2	6	24763	24768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004842	GTA	2	6	24786	24791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004842	GTG	3	9	24824	24832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004842	GCT	2	6	24837	24842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004842	GGAT	2	8	24848	24855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004842	GCG	2	6	24876	24881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004842	TGT	2	6	24882	24887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004842	AGG	2	6	24894	24899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004842	TGG	2	6	24903	24908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004842	T	6	6	24984	24989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004842	CCA	2	6	27452	27457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_004842	ATA	2	6	27485	27490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004842	CCT	2	6	27531	27536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_004842	ACC	2	6	27542	27547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_004842	TGGC	2	8	27576	27583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004842	ACTG	2	8	27584	27591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004842	GCA	2	6	27887	27892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_004842	GCT	2	6	27901	27906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004842	TGG	2	6	28764	28769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004842	GC	3	6	28782	28787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_004842	GCA	2	6	28798	28803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004842	GGC	2	6	30761	30766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_004842	GT	4	8	30830	30837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004842	CCG	2	6	30865	30870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_004842	AGG	2	6	30881	30886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004842	GTTG	2	8	30963	30970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004842	CGG	2	6	30977	30982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_004842	TCGC	2	8	31043	31050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_004842	GTA	2	6	31097	31102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004842	TGT	2	6	31169	31174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004842	CAC	2	6	32980	32985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_004842	ACC	2	6	33022	33027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_004842	CCT	2	6	33055	33060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_004842	CCA	2	6	33097	33102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_004842	CT	3	6	33106	33111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_004842	CAG	2	6	33126	33131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004842	CAC	2	6	33542	33547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_004842	GGA	2	6	33890	33895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004842	GAAGTA	2	12	33905	33916	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004842	TTA	2	6	33933	33938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004842	AAG	2	6	33947	33952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004842	TTA	2	6	33980	33985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004842	GAAG	2	8	34075	34082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004842	TAG	2	6	34083	34088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004842	GTA	2	6	34089	34094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004842	TAG	2	6	34132	34137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004842	TGA	2	6	34186	34191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004842	AGA	2	6	34222	34227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004842	ACA	2	6	34240	34245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004842	AGCAA	2	10	34252	34261	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_004842	GTAA	2	8	34262	34269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004842	GAG	2	6	34325	34330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004842	AAG	2	6	34406	34411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004842	AAG	2	6	34475	34480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004842	AGG	2	6	34485	34490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004842	AGC	2	6	34579	34584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004842	AGA	2	6	34612	34617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004842	AGA	2	6	34671	34676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004842	AG	3	6	34714	34719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004842	TAGA	2	8	34731	34738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004842	AGC	2	6	34753	34758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_004842	GGA	2	6	34768	34773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004842	AGC	2	6	34837	34842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_004842	AGA	2	6	34852	34857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004842	AGA	2	6	34903	34908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004842	GGA	2	6	34996	35001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004842	AAG	2	6	35024	35029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004842	GAAA	2	8	35058	35065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004842	AGA	2	6	35137	35142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004842	TGA	2	6	35181	35186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004842	GAA	2	6	35218	35223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004842	ATT	2	6	35238	35243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004842	GA	3	6	35264	35269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004842	TGC	2	6	35275	35280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_004842	AATT	2	8	35286	35293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004842	GCT	2	6	35294	35299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_004842	TAA	2	6	35329	35334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004842	TGA	2	6	35344	35349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_004842	CAC	2	6	35398	35403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_004842	TCAC	2	8	35418	35425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_004842	CAC	2	6	35444	35449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_004842	CAGC	2	8	35456	35463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_004842	CT	3	6	35464	35469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_004842	CCA	2	6	35516	35521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_004842	CATCT	2	10	35585	35594	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
156	NC_004842	CT	3	6	35629	35634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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160	NC_004842	CT	3	6	35735	35740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_004842	TGG	3	9	35901	35909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_004842	CA	3	6	35964	35969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_004842	CTT	2	6	35971	35976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_004842	TCA	2	6	35984	35989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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173	NC_004842	CTT	2	6	36031	36036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_004842	TAA	2	6	36121	36126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_004842	CTC	2	6	36210	36215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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182	NC_004842	AGT	2	6	36524	36529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_004842	GGT	2	6	36587	36592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_004842	GTA	2	6	36648	36653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_004842	GT	3	6	36686	36691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_004842	CTACTT	2	12	47764	47775	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_004842	CTC	2	6	47785	47790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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288	NC_004842	AG	3	6	48716	48721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_004842	AACCG	2	10	71528	71537	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
425	NC_004842	GCAT	2	8	71623	71630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
426	NC_004842	GCA	2	6	72661	72666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_004842	ACG	2	6	72730	72735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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